主持所全面工作。主管人才工作、国内外合作交流工作。分管所长办公室、植物标本馆(系统演化研究中心、图书信息中心)。联系观赏植物研究中心、植物生态与环境研究中心。
主持所党委全面工作。主管组织工作、安全和保密工作、财务工作、法务及规章制度建设工作。分管党委办公室、离退办、财务处(招标办)、园艺和科普教育中心。联系草业研究中心、果树研究中心。
主持所纪委、省监委派驻所监察专员办公室全面工作。分管纪委办公室(审计处)、监督检查处(审查调查处)。
主管规划建设工作,后勤工作,研究生教育工作。分管建设管理和后勤保卫处、植物迁地保护中心。联系药用植物研究中心。
主管科研工作、学科建设工作、学会工作、人事劳动工资、职工社会保险、职工培训工作。分管人事教育处、科技管理处。联系天然产物化学研究中心。
协助分管统战、宣传工作、离退休工作。协助分管园艺和科普教育中心工作。负责工会工作。
协助分管学科建设工作。协助分管妇女、青年、共青团工作。协助分管植物标本馆(系统演化研究中心、图书信息中心)工作。